Antes del derrocamiento de la monarquía por iniciativa de Jomeini se formó el consejo Islámico revolucionario que asumió las funciones legislativas, y el Gobierno provisional bajo la dirección de Mejdi Bazargan, el líder del partido «el Movimiento por la libertad de Irán». Dos semanas después del derrocamiento del régimen de sha se creó el Cuerpo de los guardianes de la revolución islámica, el cual se hizo el contrapeso al ejército y era la fuerza militar del clero; el clero empezó a apoyarse en el Cuerpo de los guardianes de la revolución islámica para conquistar paulatinamente las posiciones en la estructura del poder estatal.
El primer paso en esta dirección era el referéndum celebrado en marzo de 1979. En el referéndum se hacía una sola pregunta: ¿Si está de acuerdo sustituir la monarquía de sha por la república Islámica?». El 1 de abril de 1979 Irán, conforme a los resultados del referéndum, fue proclamado la república Islámica. En diciembre en el referéndum universal se aprobó la nueva constitución, que capacitó al clero dirigir el país y declaró a Jomeini como el fakij (Dirigente) vitalicio.
En noviembre de 1979 los radicalmente dispuestos estudiantes iraníes, que se llamaban "seguidores de la política del imám», capturaron la embajada de los EEUU en Teherán y declararon a su personal como rehenes. El objetivo de los extremistas era el regreso del sha a Irán para acusarlo ante el tribunal. En respuesta los EEUU pararon la importación del petróleo iraní y congelaron las cuentas iraníes en los bancos americanos. Bazargan dimitió, después de las elecciones en el medjlis Ali Radjai se hizo el primer ministro. A pesar de la muerte del sha, no se liberó a los rehenes americanos. En 1980 con la intermediación de Argelia y el primer presidente de República islámica de Irán Abolhasan Banisadr (elegido en enero de 1980) elaboraron un acuerdo, según el que los americanos se liberaban a cambio de descongelación de los activos iraníes. La realización del acuerdo fue bloqueada por los partidarios de la línea dura, que luchaban por la derrota de J. Cárter en las elecciones presidenciales en los EEUU, las cuales se celebraron en noviembre. Los rehenes fueron liberados durante la inauguración de Ronald Reagan el 20 de enero de 1981.
La guerra con Irak (1980-1988).
La guerra con Irak, que había comenzado en septiembre de 1980, agudizó las contradicciones entre diferentes fuerzas políticas, especialmente en cuestión de la intervención directa del clero en la dirección del país. La línea de Banisadr para restringir tal intervención, fue apoyada por la Organización de los muyahides del pueblo iraní (Modyahedine Jalk). Después de la intervención de los muyahides en junio de 1981 el medjlis le declaró el impeachment a Banisadr. Por la instrucción de Jomeini él fue destituido y con la ayuda de los muyahides huyó del país. En julio se celebraron las nuevas elecciones presidenciales, en las que ganó el primer ministro Radjai, y el puesto de primer ministro lo ocupó Mohammed Yabar Bajonar. A finales de agosto Radjai y Bajonar fueron asesinados en resultado de la explosión de bomba, la responsabilidad por el atentado el gobierno la cargó sobre los muyahides. En octubre hodyat-ol-eslam Seyed Ali Jamenei se hizo el presidente, el puesto del primer ministro lo ocupó Mir Hosein Musavi. En agosto de 1985 Jamenei fue reelegido al puesto del presidente. El gobierno declaró la islamización de la sociedad y la liberación de la influencia del Occidente como tarea principal. Los millares de los iraníes que habían recibido la educación laica, emigraron a Turquía, Europa y América del Norte. Las normas islámicas se introducían en la vida cotidiana, vida social, el sistema político, en la economía. La efectuada revolución cultural por la labor principal ponía la introducción de las normas islámicas en la enseñanza.
La guerra continuó durante 8 años, sin haber traído la victoria a ninguna de las partes. Las pérdidas totales de las destrucciones se valoran en 300-350 mil millones de dólares; los golpes especialmente fuertes recibieron los objetos de la industria petrolera en el sur del país. Durante la guerra Irán tuvo que estacionar 1,5 millones de emigrantes procedentes de las regiones de operaciones militares. Además, durante los mismos años 2,3 mln. de los refugiados de Afganistán se instalaron en el país. En 1988 Irán consintió el cese de hostilidades.
Irán en los tiempos de Rafsanjani
Entonces el país tenía que resolver los problemas de reconstitución de la economía destruida. De nuevo se acaloraron las divergencias en cuestión de las vías del desarrollo. El partido republicano islámico, que había jugado el papel del coordinador de todas las agrupaciones del clero, fue desconvocado (1987), para resolver las contradicciones entre el medjlis y el consejo de observación Jomeini permitió formar un órgano conciliatorio adicional, en su vida comenzaron a elaborar el primer plan quinquenal que se hizo la base legislativa de la nueva política económica. Irán empezó a aplicar los esfuerzos para restablecer contactos con los países del golfo Pérsico, ante todo con Kuwait y la Arabia Saudí.
Jomeini falleció el 3 de junio de 1989. El Consejo de los expertos elegió a fakij Seyed Ali Jamenei como su sucesor. En julio se celebraron las nuevas elecciones presidenciales y el referéndum para hacer enmiendas en la constitución, una de las enmiendas más importantes era la anulación del puesto de primer ministro. El speaker del medjlis Ali Akbar Hashemi-Rafsanjani fue elegido al puesto del presidente. El gobierno de Rafsanjani comenzó a realizar la política de la liberalidad económica, restringiendo la intervención del estado en la economía, él consiguió que el medjlis y Consejo de observación permitiera el uso del capital extranjero. La liberalidad de los precios y el programa de la privatización realizados a principios de los años 90 llevaron a una serie de manifestaciones en las ciudades del país, pero en general el programa económico del gobierno fue apoyado; en las elecciones parlamentarias, celebradas en primavera de 1992, los partidarios de Rafsanjani recibieron más de 70 % de los votos.
Después de la agresión iraquí contra Kuwait en agosto de 1990 Irak concertó la paz con Irán, habiendo reconocido sus pretensiones, después de lo que se restablecieron las relaciones diplomáticas bilaterales. Irán reprobó la invasión de Kuwait y observaba las sanciones de la ONU contra Irak, sin embargo al mismo tiempo se manifestó contra la expansión de las fuerzas multinacionales encabezadas por los EEUU en la zona del golfo Pérsico e insistía en la retirada de la región de todo el ejército extranjero. En junio de 1991 los EEUU recomenzaron la importación del petróleo iraní, pero continuaron la política de limitación de las ventas de nuevos pertrechos a Irán. Las relaciones con los estados del golfo Pérsico se quedaban tensas debido al conflicto por tres islas en el golfo (Abu-Musa, Tombe-Bozorg y Tombe-Kuchek).
La actividad de Jatami.
La liberalidad económica de la sociedad reforzó las exigencias por la democratización de la vida social y política, y por progreso en las relaciones con la comunidad mundial. El resultado de estas exigencias fue la elección al puesto del presidente en 1997 de Hodyat-ol-eslam Mohammed Jatami - el partidario de las reformas y mejoramiento de las relaciones con el Occidente. Jatami adelantó la concepción «del diálogo de las civilizaciones», realizando paso a paso la política del mejoramiento de las relaciones de Irán con la comunidad mundial. La política de Jatami, que era el líder de las fuerzas reformadoras, encontró el apoyo entre la población del país, los reformadores constituyeron la mayoría de los elegidos en el medjlis de la sexta convocación (en 2000). En 2001 Jatami de nuevo fue reelegido al puesto del presidente. Durante la actividad de Jatami se activó evidentemente la vida de partido, la prensa se hizo más independiente. La vida pública aceptaba las formas cada vez más democráticas y civilizadas. Cada vez más la influencia europea penentraba en la vida cotidiana, ética laboral, cultura y las relaciones económicas.
En la política exterior el gobierno de Jatami seguía las normas de uso general, en cuanto a las operaciones antiterroristas militares en Afganistán e Irak, asumió la posición neutral, pero se opuso a la estancia del ejército extranjero en los países, vecinos a él.
Sin embargo, el gobierno de Jatami no consiguió alcanzar los cambios decisivos en el aumento de nivel de vida de la población, en la creación de una sociedad verdaderamente civil. Los proyectos de ley aportados por Jatami, que debían cambiar la correlación de fuerzas en beneficio de los órganos republicanos, no fueron aceptados debido a la posición de los conservadores. A pesar de la aprobación de las acciones de los EEUU en Afganistán e Irak, las sanciones americanas contra Irán, introducidas a mediados de los años 90, no fueron anuladas, lo cual se estimaba por los conservadores como los errores de la política exterior del gobierno de los reformadores. Los resultados de las elecciones municipales (2003) ya mostraron la disminución de popularidad de los reformadores, en las elecciones en el medjlis de la séptima convocación (2004) ganaron los partidarios de los conservadores.
En Irán diferentes partidos y grupos siguen discutiendo por las vías del desarrollo tanto político, como económico. Unos de los neo-reformadores que han llegado al poder en el medjlis declaran que el modelo japonés es uno de los más perspectivos para Irán, otros prefieren el modelo chino. Irán se encuentra en el período crítico del desarrollo histórico, en el que lo principal no es la elección del modelo económico, sino el establecimiento de una correlación de los comienzos laicos y religiosos en el sistema político de la sociedad, que pueda asegurar la posibilidad de modernización completa del país.
El 24 de junio de 2005 en la segunda vuelta de las elecciones presidenciales ganó el conservador Mahmud Ahmadineyad, que en la actualidad realiza la actividad presidencial en el país.